合作之企業對象有:瑞寶基因、國盛生化、善笙生技、貿暉實業、百衛生技、日本共立製藥、淨旦生技、美國禮來、祥圃、國興畜產、台灣英特威動物藥品、台灣百靈佳、又誠、欣昌錦鯉、中國化學製藥、福又達生技、集美家畜醫院、金自然、比利時商浩衛製藥、集美農產、施懷哲維克生技、經農、泰豪國際、台灣龍馬躍、益瑞、宏興畜牧場、全民生技、淨園國際開發、碩騰生技、元氣動物醫院、恆春海洋養殖、勝杰動物醫院、佳愛動物醫院、北投動物醫院、豐盛動物醫院、崇恩動物醫院、宏力動物醫院、永信藥品工業、台灣維克法蘭斯等。
獸醫學院與企業界積極交流,目前已簽訂之企業共計11家,如下表: